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フリーランスエンジニアの確定申告ガイド|初心者でも失敗しない基礎知識と節税術

はじめに

フリーランスエンジニアを目指す、もしくはすでに活動をしている皆さんにとって、「税金」や「確定申告」は少し遠い世界の話に聞こえるかもしれません。しかし、自由に働くスタイルを選ぶなら、これらは避けて通れない大切な知識です。

この記事では、専門用語をイメージしやすいように噛み砕き、フリーランスエンジニアが知っておくべき「お金のルール」を分かりやすく解説します!

フリーランスエンジニアの確定申告:基礎知識

エンジニアとして独立して働くということは、プログラミングをするだけでなく、「自分の会社の経理部長」も兼ねるということです。そのメインイベントが「確定申告」です。

確定申告って、そもそも何?

確定申告とは、「1月1日から12月31日までの1年間に、いくら稼いで(収入)、いくら使ったか(経費)」を計算し、国(税務署)に「私の今年の税金はこれくらいです!」と報告する手続きのことです。

日本では、所得税(お給料や利益にかかる税金)は「自分で計算して自分から言いに行く」というルールになっています。学校のテストのように、自動的に採点されて結果が送られてくるわけではなく、自分で採点表(申告書)を作って提出しなければなりません。

会社員(サラリーマン)との違い

「うちの両親は会社に勤めているけど確定申告なんてしてないよ?」と思うかもしれません。それは、会社が「年末調整」という作業を代わりにやってくれているからです。会社員は、会社が毎月のお給料から少しずつ税金を天引きし、年末にまとめて帳尻を合わせてくれます。

しかし、フリーランスには「会社」がありません。自分でお金の管理をしなければならないのです。

「収入」と「所得」は全然違う!

ここが一番大事なポイントです。

  • 収入(売上): お客さんから支払われたお金の「全額」です。

  • 経費: 仕事をするために使ったお金(パソコン代、ネット代など)です。

  • 所得(利益): 収入から経費を引いた「手残り」のことです。

「所得 = 収入 - 経費」

税金は「収入」ではなく、この「所得」に対してかかります。例えば、500万円稼いでも、経費で500万円使っていたら、あなたの所得は0円なので税金もかかりません(※実際には生活できなくなりますが)。


2. どんな人が確定申告をしなければならないの?

「フリーランスになったら全員絶対に申告!」というわけではありません。条件があります。

年間の所得が48万円(基礎控除)を超える人

基本的には、1年間の所得が48万円を超える場合に申告が必要です。

なぜ48万円かというと、日本に住んでいる人なら誰でも「所得から48万円引いていいよ」という**「基礎控除」**というボーナスルールがあるからです。所得が48万円以下なら、引くと0円になるので税金が発生しません。

高校生が「副業」や「兼業」で稼ぐ場合

もしあなたが将来、どこかの会社でアルバイトをしながら、休日だけフリーランスエンジニアとしてアプリを作って稼ぐなら、注意が必要です。

  • 年収2,000万円超: 給料が高い人は自分で申告が必要です。

  • 副業の利益が20万円超: アルバイト以外に、エンジニアとして稼いだ「所得」が年間20万円を超えたら、確定申告をしなければなりません。


3. フリーランスエンジニアの稼ぎ方と「売上」のタイミング

エンジニアの仕事にはいくつか形があります。いつ「売上」が発生したとみなすか、これが確定申告では非常に重要です。

「準委任(じゅんいにん)」と「請負(うけおい)」

エンジニアの契約には大きく2種類あります。

  1. 準委任契約: 「月100時間働きます」というように、「時間や労働」に対してお金をもらう形。

  2. 請負契約: 「このWebサイトを完成させます」というように、**「完成品」**に対してお金をもらう形。

「準委任」と「請負」の違いは、仕事の完成を目的としているか否かです。準委任契約の場合、作業時間あたりの報酬となり、仕事の完成は報酬に関係しません。

他方、請負契約では、仕事を完成させることが目的となります。例えば、Webサイトの制作やアプリ開発などです。したがって、予定していた時間を超過しても、契約上の仕事が完成するまで作業が必要となります。

売上を計上するタイミング

ここが間違いやすいポイントです。「お金が銀行に振り込まれた日」ではなく、「仕事が終わった(納品した)日」で計算します。 12月に仕事を終えて、お給料が振り込まれるのが1月だったとしても、それは「去年の売上」としてカウントしなければなりません。年をまたぐときは要注意です!

クラウドソーシングを利用する際には、プラットフォーム側に支払う手数料や報酬の振込手数料なども確認しておきましょう。また、源泉徴収についても確認が必要です。

クラウドソーシングやブログの収入

  • クラウドソーシング: ランサーズやクラウドワークスなどで稼いだお金。

  • 副収入: 自分の技術ブログの広告(Google AdSense)や、有料記事(note)の販売。

これらもすべて「収入」としてまとめます。売上の計上漏れなどを起こしやすくなるので注意しましょう。


4. 確定申告のスケジュールとペナルティ

確定申告には厳しい締め切りがあります。

3月15日がデッドライン

確定申告の期間は、毎年「2月16日から3月15日まで」です。 もし3月15日が土日の場合は、次の月曜日が期限になります。「申告書を出す」のと「税金を払う」のを、両方この日までに終わらせる必要があります。

期限を過ぎたらどうなる?

もし忘れてしまったら、「無申告加算税」「延滞税」という、いわゆる罰金(利息)が上乗せされます。 遅れれば遅れるほど、払う金額が増えてしまいます。ただし、わざとではなく、期限から1ヶ月以内に「あ!忘れてた!」と自分から正直に申告すれば、罰金が免除されることもあります。


5. 確定申告の具体的な5ステップ

実際にどうやって進めるのか、流れを見てみましょう。

  1. 青色か白色か選ぶ: 最初におトクな「青色申告」か、簡単な「白色申告」か決めます(後で詳しく説明します)。

  2. 書類を集める: 請求書、領収書、レシートなどをかき集めます。

  3. 申告書を作る: 今は「会計ソフト」や、国税庁のWebサイトにある「作成コーナー」で、数字を入れるだけで自動計算してくれます。

  4. 提出する: スマホやパソコンから「e-Tax(電子申告)」で送るのが一番楽です。

  5. 税金を払う(または返してもらう): 銀行振込やクレカ、コンビニなどで払います。逆に、税金を払いすぎていた場合は「還付金」としてお金が返ってくる嬉しいパターンもあります!


6. エンジニアが「経費」にできるもの

フリーランスエンジニアは、仕事に関係ある出費なら「経費」にできます。経費が増えると「所得」が減り、その分だけ「税金」が安くなります(これを節税と言います)。

どんなものがOK?

  • ハードウェア: パソコン、モニター、キーボード、マウスなど。

  • ソフトウェア・サブスク: GitHub、Adobe、ChatGPT Plus、Notionなどの利用料。

  • 学習費用: 技術書、オンライン動画講座、プログラミングスクールの月謝。

  • 通信費: 家のネット代やスマホ代(プライベートと分けて仕事で使う分だけ)。

  • カフェ代・スペース代: コワーキングスペースの利用料など。

「家事按分(かじあんぶん)」という考え方

例えば、家賃10万円の部屋で、1日24時間のうち8時間仕事をしているなら、家賃の3分の1を経費にできるかもしれません。このように、生活用と仕事用を「割合で分ける」ことを家事按分と言います。


7. 注意点:初心者がやりがちなミス

クラウドソーシングの「源泉徴収(げんせんちょうしゅう)」

クラウドソーシングでは、あらかじめ税金が引かれた金額が振り込まれることがあります。 例えば「1万円の仕事」なのに「9千円」しか振り込まれない場合、引かれた千円は「先に国に払った税金」です。確定申告のときにこの「千円」をちゃんと書かないと、税金の二重払いになって損をしてしまいます!

手数料の入れ忘れ

振込手数料やサイトのシステム利用料も立派な「経費」です。これらを計上し忘れると、無駄に税金を多く払うことになります。


8. フリーランスに有利な「節税」のテクニック

「どうすれば手取りが増えるか」を知っておいて損はありません。

青色申告特別控除(最大65万円!)

これは最強の節税術です。少し難しいルールで帳簿をつけるだけで、国が**「あなたの所得から最大65万円引いてあげます!」**と言ってくれます。 昔は大変でしたが、今はスマホアプリの会計ソフトを使えば、簿記の知識がなくても簡単に青色申告ができるようになっています(2026年1月時点)。

iDeCo(イデコ)やふるさと納税

  • iDeCo: 自分のための年金(貯金)をすると、その全額が所得から引かれます。

  • ふるさと納税: 地方に寄付をして返礼品(お肉やフルーツなど)をもらいつつ、税金を安くできる制度です。


9. 避けて通れない「インボイス制度」と「消費税」

最近ニュースでよく聞く「インボイス制度」。これはフリーランスエンジニアにとって非常に重要なルールです。

なぜエンジニアにインボイスが必要?

IT企業にお仕事を頼まれるとき、あなたが「インボイス(適格請求書)」を出せないと、企業側の税金が高くなってしまう仕組みになりました。 そのため、「インボイス登録をしていないエンジニアとは取引しません」とか「その分値下げしてください」と言われるリスクがあります。プロとして稼ぐなら、この登録が必要かどうかを考える時期がいずれやってきます。

消費税の申告

これまでは「売上1,000万円以下なら消費税は払わなくていいよ」という免税ルールがありましたが、インボイスに登録すると売上に関わらず消費税を納める必要があります。ただ、現在は「2割特例」といって、払う消費税をグッと安くしてくれる救済措置もあります(2026年1月時点)。


10. 困ったときはプロ(税理士)を頼る

ここまで読んで「うわ、大変そう……プログラミングだけに集中したい!」と思ったあなた。正解です。 エンジニアの中には、面倒な作業をすべて税理士さんにお願いする人もたくさんいます。

税理士に頼むメリット

  1. 間違いがない: 税務署から怒られる心配がなくなります。

  2. 節税アドバイス: 「これ経費にできますよ」と教えてくれます。

  3. 時間の節約: 書類を作る時間を、新しいスキルの勉強や開発にあてられます。


まとめ

フリーランスエンジニアの確定申告は

自分のビジネスの状態を正しく把握し、国に報告する責任

です。

フリーランスとして活動する中で、「何から始めればいいんだ?」とパニックにならないための準備は今日から始まっています。 まずは「お金を使ったらレシートをもらう」という習慣をつけるだけでも、大きな一歩ですよ!

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